Ngoài dành phần lớn thời gian cho việc đóng phim, chăm sóc gia đình và kinh doanh, Jennifer Garner được biết đến là một nghệ sĩ có mối quan tâm đặc biệt đến các hoạt động vì trẻ em. Cô hiện là thành viên của tổ chức phi chính phủ Save the children và từng ủng hộ các chiến dịch chống lại sự tấn công của cánh săn ảnh nhắm vào con cái của các ngôi sao nổi tiếng.